<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">ophthalmology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Офтальмология</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Ophthalmology in Russia</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1816-5095</issn><issn pub-type="epub">2500-0845</issn><publisher><publisher-name>Ophthalmology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.18008/1816-5095-2020-4-824-829</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">ophthalmology-1381</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>КЛИНИЧЕСКИЙ СЛУЧАЙ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>CASE REPORT</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Эффективность ПЦР-диагностики грибковых кератитов</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>The Effectiveness of PCR in Diagnosis of Fungal Keratitis</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-7052-3294</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Кричевская</surname><given-names>Г. И.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Krichevskaya</surname><given-names>G. I.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник отдела иммунологии и вирусологии ул. Садовая-Черногрязская, 14/19, Москва, 105062</p></bio><bio xml:lang="en"><p>PhD, leading researcher of immunology and virology department,</p><p>Sadovaya-Chernogriazskaya str., 14/19, Moscow, 105062</p></bio><email xlink:type="simple">gkri@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-6239-9553</contrib-id><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Ковалева</surname><given-names>Л. А.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kovaleva</surname><given-names>L. A.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>научный сотрудник отдела вирусных и аллергических заболеваний глаз,</p><p>ул. Садовая-Черногрязская, 14/19, Москва, 105062</p></bio><bio xml:lang="en"><p>researcher of infectious and allergic eye diseases department,</p><p>Sadovaya-Chernogriazskaya str., 14/19, Moscow, 105062</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Зюрняева</surname><given-names>И. Д.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zyurnyayeva</surname><given-names>I. D.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>врач-бактериолог вирусологической микробиологической лаборатории,</p><p>ул. Садовая-Черногрязская, 14/19, Москва, 105062</p></bio><bio xml:lang="en"><p>bacteriologist of virological and bacteriological laboratory,</p><p>Sadovaya-Chernogriazskaya str., 14/19, Moscow, 105062</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Макаров</surname><given-names>П. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Makarov</surname><given-names>P. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, ведущий научный сотрудник отдела травматологии и реконструктивной хирургии,</p><p>ул. Садовая-Черногрязская, 14/19, Москва, 105062</p></bio><bio xml:lang="en"><p>MD, leading researcher of ocular trauma and reconstructive surgery department,</p><p>Sadovaya-Chernogriazskaya str., 14/19, Moscow, 105062</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Андрюшин</surname><given-names>А. Е.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Andryushin</surname><given-names>A. E.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>научный сотрудник отдела иммунологии и вирусологии,</p><p>ул. Садовая-Черногрязская, 14/19, Москва, 105062</p></bio><bio xml:lang="en"><p>researcher of immunology and virology department,</p><p>Sadovaya-Chernogriazskaya str., 14/19, Moscow, 105062</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru"><institution>ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр глазных болезней им. Гельмгольца»&#13;
Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution><country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en"><institution>Moscow Helmholtz Research Institute of Eye Diseases</institution><country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2020</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>27</day><month>12</month><year>2020</year></pub-date><volume>17</volume><issue>4</issue><fpage>824</fpage><lpage>829</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Кричевская Г.И., Ковалева Л.А., Зюрняева И.Д., Макаров П.В., Андрюшин А.Е., 2020</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Кричевская Г.И., Ковалева Л.А., Зюрняева И.Д., Макаров П.В., Андрюшин А.Е.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Krichevskaya G.I., Kovaleva L.A., Zyurnyayeva I.D., Makarov P.V., Andryushin A.E.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.ophthalmojournal.com/opht/article/view/1381">https://www.ophthalmojournal.com/opht/article/view/1381</self-uri><abstract><p>Кератомикозы вызываются разными грибами. Для верификации диагноза используют микробиологические анализы (микроскопия мазка, посев на культуральные среды). Недостатки микробиологических методов: существенное снижение чувствительности под влиянием предыдущего лечения, длительность получения ответа (посев учитывают на 3–7-й день).</p><sec><title>Цель</title><p>Цель. Оценить эффективность полимеразной цепной реакции (ПЦР) в диагностике кератомикозов в сравнении с культуральным методом.</p></sec><sec><title>Пациенты и методы</title><p>Пациенты и методы. Наблюдения выполнены у семи пациентов с тяжелой тотальной язвой роговицы длительностью более 3 недель. Биоматериал (соскобы с язвы роговицы и фрагменты роговиц, удаленных при сквозной кератопластике) исследовали в ПЦР реального времени и микробиологическими методами. В ПЦР использовали диагностический набор для дифференциального выявления ДНК Candida albicans и суммарной ДНК грибов (Fungi), позволяющий обнаруживать большинство патогенных грибов без определения их вида. Микробиологические методы включали микроскопию мазков, окрашенных по Грамму и 1 % раствором метиленовой сини, посев на питательные среды, в том числе на селективную среду для грибов (агар Сабуро с хлорамфениколом).</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. ПЦР: во фрагментах всех удаленных при кератопластике роговиц (6 пациентов) выявлена общая для грибов ДНК (ДНК Fungi) и не обнаружена ДНК Сandida albicans, что коррелировало с результатами посева на среду Сабуро (плесневые грибы обнаружены в 5 из 6 роговиц). В соскобах с роговиц, взятых до операции, также выявлена ДНК Fungi; однако рост грибов при посеве на различные питательные среды не был обнаружен.</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. Грибковые язвы роговицы — тяжелое заболевание, нередко приводящее к инвалидизации по зрению. Быстрое определение этиологии и правильный выбор терапии определяют исходы заболевания. Преимущество ПЦР по сравнению с культуральным методом: быстрота получения результатов (4 часа вместо 3–7 дней); высокая чувствительность, позволяющая выявлять грибы не только в ткани удаленной роговицы, но и в соскобах с язвы роговицы больных, ранее получавших противогрибковую терапию. Наличие коммерческих наборов для дифференциального выявления общей для грибов ДНК и ДНК Сandida albicans расширяет возможности ПЦР при скрининговой диагностике грибковых кератитов и выборе препаратов до определения вида возбудителя. </p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Fungi implicated in mycotic keratitis include different species. Conventional methods for the diagnosis of fungal keratitis include staining of corneal scarpings, culture medium (Sabouraud agar) for isolating fungi.</p><sec><title>Purpose</title><p>Purpose. To evaluate the effectiveness of polymerase chain reaction (PCR) for the detection of fungal etiology in comparison with the conventional diagnostic methods in cases with suspected fungal corneal ulcer.</p></sec><sec><title>Patients and methods</title><p>Patients and methods. Seven patients with severe corneal ulcers with more than 3 weeks duration. Corneal scarpings and corneal buttons from seven patients who had undergone therapeutic keratoplasty were used for microbiological and PCR analysis. PCR diagnostic kits for the differential detection of Candida albicans DNA and total fungi DNA (DNA Fungi), which allows to identify most pathogenic fungi without determining their species were used. Microbiological methods: microscopy of gramstained smears, culture techniques, including selective for fungi agar Saburo with chloramphenicol.</p></sec><sec><title>Results</title><p>Results. PCR: Fragments of all corneas removed from keratoplasty (6 patients) revealed fungal-common DNA (Fungi DNA) and did not detect Candida albicans DNA, which correlated with sowing results on Saburo medium (mold fungi found in 5 of 6 corneas). Fungi DNA was also detected in the corneal scraps taken prior to surgery; however, growth of fungi during sowing on various nutrient media was not found.</p></sec><sec><title>Conclusion</title><p>Conclusion. Corneal fungal ulcers are a serious disease, often leading to visual disability. The rapid determination of etiology and the correct choice of therapy determines the outcomes of the disease. The advantage of PCR over the culture method: the speed of obtaining results (4 hours instead of 3–7 days); high sensitivity, which allows detecting fungi not only in the tissue of the removed cornea, but also in scrapes from the cornea ulcer of patients who previously received antifungal therapy. The presence of commercial kits for differential detection of fungal-common DNA and DNA of Candida albicans extends the possibilities of PCR in the screening diagnosis of fungal keratitis and the selection of drugs before determining the type of pathogen. </p></sec></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>грибковые язвы роговицы</kwd><kwd>лабораторная диагностика</kwd><kwd>ПЦР</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>fungal corneal ulcers</kwd><kwd>laboratory diagnostics</kwd><kwd>PCR</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Jurkunas U., Behlau I., Colby K. Fungal keratitis: changing pathogens and risk factors. Cornea. 2009;28(6):638–643. DOI: 10.1097/ICO.0b013e318191695b</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Jurkunas U., Behlau I., Colby K. Fungal keratitis: changing pathogens and risk factors. Cornea. 2009;28(6):638–643. DOI: 10.1097/ICO.0b013e318191695b</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Farell S., VcElnea E., Moran S., Knowles S., Murphy C.C. Fungal keratitis in the Republic of Ireland. Eye. 2017;31:1427–1434. DOI: 10.1038/eye.2017.82</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Farell S., VcElnea E., Moran S., Knowles S., Murphy C.C. Fungal keratitis in the Republic of Ireland. Eye. 2017;31:1427–1434. DOI: 10.1038/eye.2017.82</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Скрябина Е.В., Астахов Ю.С., Коненкова Я.С., Касымов Ф.О., Зумбулидзе Н.Г., Варганова Т.С., Петухов В.П., Пиргунова А.А., Масян Я., Климко Н.Н., Богомолова Т.С., Десятик Е.А. Диагностика и лечение грибкового кератита. Часть I. Офтальмологические ведомости. 2018;11(3):63–73. DOI: 10.17816/OV11363-73</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Skryabina Y.V., Astakhov Y.S., Konenkova Y.S., Kasymov Y.V., Zumbulidze N.G., Varganova T.S., Petukhov V.P., Pirgunova A.A., Masian J., Klimko N.N., Bogomolova T.S., Desyatik E.A. Diagnosis and treatment of fungal keratitis. Part I. Ophthalmology Journal = Oftal’mologicheskie vedomosti. 2018;11(3):63–73 (In Russ.)] DOI: 10.17816/OV11363-73</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Keay L.J., Gower E.W., Lovieno A., Oechsler R.A., Alfonso E.C., Matoba A., Colby K., Tuli S.S., Hammersmith K., Cavanagh D., Lee S.M., Irvine J., Stulting R.D., Mauger T.F., Schein O.D. Clinical and microbiological characteristics of fungal keratitis in the United States, 2001–2007: a multicenter study. Ophthalmology. 2011 May;118(5):920–926. DOI: 10.1016/j.ophtha.2010.09.011</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Keay L.J., Gower E.W., Lovieno A., Oechsler R.A., Alfonso E.C., Matoba A., Colby K., Tuli S.S., Hammersmith K., Cavanagh D., Lee S.M., Irvine J., Stulting R.D., Mauger T.F., Schein O.D. Clinical and microbiological characteristics of fungal keratitis in the United States, 2001–2007: a multicenter study. Ophthalmology. 2011 May;118(5):920–926. DOI: 10.1016/j.ophtha.2010.09.011</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Делягин В.М., Мельникова М.Б., Першин Б.С., Серик Г.И., Джандарова Т.Т. Грибковое поражение глаз (диагностика, лечение). Практическая медицина. 2015;2(87):100–105.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Delyagin V.M., Melnikova M.B., Pershin B.S., Serik G.I., Dzhandarova D.T. Fungal damage of eyes (diagnosis and treatment). Practical medicine = Practicheskaya meditsina. 2015;2(87):100–105 (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Kaufmann C., Frueh B.E., Messerli J., Bernauer W., Thiel M.A. Contact lensassociated fusarium keratitis in Switzerland. Klin Monbl Augenheilkd. 2008 May;225(5):418–421. DOI: 10.1055/s-2008-1027357</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Kaufmann C., Frueh B.E., Messerli J., Bernauer W., Thiel M.A. Contact lensassociated fusarium keratitis in Switzerland. Klin Monbl Augenheilkd. 2008 May;225(5):418–421. DOI: 10.1055/s-2008-1027357</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Manikandan P., Abdel-Hadi A., Randhir Babu Singh Y., Revathi R., Anita R., Banawas S., Bin Dukhyil A.A., Alshehri B., Shobana C.S., Panneer Selvam K., Narendran V. Fungal Keratitis: Epidemiology, Rapid Detection, and Antifungal Susceptibilities of Fusarium and Aspergillus Isolates from Corneal Scrapings. Biomed Res Int. 2019 Jan 20; 2019:6395840. DOI: 10.1155/2019/6395840. eCollection 2019</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Manikandan P., Abdel-Hadi A., Randhir Babu Singh Y., Revathi R., Anita R., Banawas S., Bin Dukhyil A.A., Alshehri B., Shobana C.S., Panneer Selvam K., Narendran V. Fungal Keratitis: Epidemiology, Rapid Detection, and Antifungal Susceptibilities of Fusarium and Aspergillus Isolates from Corneal Scrapings. Biomed Res Int. 2019 Jan 20; 2019:6395840. DOI: 10.1155/2019/6395840. eCollection 2019</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Бельская К.И., Обрубов А.С. Некультуральные методы диагностики грибковых кератитов. РМЖ «Клиническая Офтальмология». 2018;1:37–41.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Belskaya K.I., Obrubov A.S. Non-cultural diagnostic methods of fungal keratitis. Russian Medical Journal. Clinical Ophthalmology  = Rossijskiy medicinskiy zhurnal. Klinicheskaya oftal’mologiya. 2018;1:37–41 (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Mahmoudi S., Masoomi A., Ahmadikia K., Tabatabaei S.A., Soleimani M., Rezaie S., Ghahvechian H., Banafsheafshan A. Fungal keratitis: An overview of clinical and laboratory aspects. Mycoses. 2018 Dec;61(12):916–930. DOI: 10.1111/myc.12822</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Mahmoudi S., Masoomi A., Ahmadikia K., Tabatabaei S.A., Soleimani M., Rezaie S., Ghahvechian H., Banafsheafshan A. Fungal keratitis: An overview of clinical and laboratory aspects. Mycoses. 2018 Dec;61(12):916–930. DOI: 10.1111/myc.12822</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Полтанова Т.И., Белоусова Н.Ю. Рецидив грибкового кератита в роговичном трансплантате. Казанский медицинский журнал. 2018;99(1):148–150. DOI: 10.17816/KMJ2018-1485</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Poltanova T.I., Belousova N.Yu. Recurrence of fungal keratitis in corneal transplant. Kazanskiy meditsinskiy zhurnal = Kazan medical journal. 2018;99(1):148–150 (In Russ.). DOI: 10.17816/KMJ2018-1485</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Искендерли В.Б. Значимость этиологической структуры возбудителей в развитии и поддержании разных клинических форм офтальмомикозов. Биомедицина. 2018;2:10–12.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Iskenderli V.B. The importance of the etiological structureof causative agents in the development andmaintenance of different clinical forms of ophthalmic mycosis living in Azerbaijan. Biomedicine  = Biomeditsina. 2018;2:10–12 (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Maharana P.K., Sharma N., Nagpal R., Jhanji V., Das S., Vajpayee R.B. Recent advances in diagnosis and management of Mycotic Keratitis. Indian J Ophthalmol. 2016 May;64(5):346–357. DOI: 10.4103/0301-4738.185592</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Maharana P.K., Sharma N., Nagpal R., Jhanji V., Das S., Vajpayee R.B. Recent advances in diagnosis and management of Mycotic Keratitis. Indian J Ophthalmol. 2016 May;64(5):346–357. DOI: 10.4103/0301-4738.185592</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Embong Z., Wan Hitam W.H., Yean C.Y., Rashid N.H., Kamarudin B., Abidin S.K., Osman S., Zainuddin Z.F., Ravichandran M. Specific detection of fungal pathogen by 18S rRNA gene PCR in microbial keratitis. BMC Ophthalmol. 2008;29(8):7. DOI: 10.1186/1471-2415-8-7</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Embong Z., Wan Hitam W.H., Yean C.Y., Rashid N.H., Kamarudin B., Abidin S.K., Osman S., Zainuddin Z.F., Ravichandran M. Specific detection of fungal pathogen by 18S rRNA gene PCR in microbial keratitis. BMC Ophthalmol. 2008;29(8):7. DOI: 10.1186/1471-2415-8-7</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit14"><label>14</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Фоменко Н.В., Иванов М.К. Проблемы эффективного выявления возбудителей микозов слизистых урогенитального тракта. Новости «Вектор-Бест». 2012;4(66):2–7.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Fomenko N.V., Ivanov M.K. The problem of efficient identification of causative agents of mycoses of the mucous membranes of the urogenital tract. News «Vector-Best» = Novosti «Vektor-Best» 2012;4(66):2–8 (In Russ.).</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
